近未來，一顆行星從地球一萬千米處擦肩而過。 隨着災難而來的，還有魔物。 從那一天開始，人類便在魔物的攻擊下節節敗退——直到三個月後，新的不知名的物質元素也在人類世界中引起了變化，一部分的少年少女們擁有了被稱為“魔法”的能力，人類終於有了反抗的力量。 三年後，被譽為最強魔法師的少年青野真斗，一個人摧毀了最高級別的魔物巢穴，讓人類贏得了喘息的機會。 而作為代價，他也失去了使用魔法的能力，變成了一個普通人。 兩年後，青野真斗再一次接收到了命令。他將作為一個普通學生，前往目的是培養精英魔法師的百葉高級中學。 失去魔法的少年，究竟能夠在這裡遇到什麼樣的人物，又有着什麼樣的命運呢。 以科學為名的魔法幻想，就此開幕——