綠蘿鎮，美麗的小鎮，小鎮中所有人及寶可夢一起和睦相處的生活着，自小智脫離團隊后，莎莉娜及夥伴們，還在享受着優雅的生活，唯獨小光的卷卷耳還思念着離開的皮卡丘，除此之外，小智所有的寶可夢也向遠處望去，盼望着小智能儘早回來，可是，不知道為什麼，小智的仙子精靈卻遲遲不見蹤影。
莎莉娜他們也嘗試過尋找小智那隻獨一唯二的仙子精靈，然而，踏遍整個綠蘿鎮，都未見那隻仙子精靈，此外，也許是受到莎莉娜的影響，莎莉娜的寶可夢們，也像莎莉娜一樣悠閑自得，或許也在擔心小智和皮卡丘的安危，但並沒有表現出來吧。
如此綠意盎然的小鎮，卻也逃不過坂木的侵略計劃，因為，此時此刻，綠蘿鎮的天空開始變得陰暗起來，天空變暗之時，小鎮里開始入侵了所有火箭隊成員，以及之前還把小智打成重傷的超夢。
“坂木老大的計劃是真的天衣無縫啊，在所有人都在享受美好生活的同時，直接大規模的侵略這個地方！”跟在大部隊後面的武藏說道。
此刻，原本還在享受的莎莉娜以及夥伴們，都被突如其來聲音給影響了，為了了解事情的來龍去脈，莎莉娜和夥伴們立刻來到了戰場，他們所看到的，則是被打成重傷的訓練家及寶可夢。
“這，是怎麼回事？為什麼這裡看起來像是剛受到攻擊一樣？地面上有好多失去戰鬥能力的寶可夢和受到重傷的訓練家？”發現事情嚴重性的，則是第一個沖在前面的莎莉娜。
“也許，我該用我的新發明——時空回溯機來了解一下事情的經過！”興緻滿滿的希特隆不知什麼時候從他手裡拿出了一個奇怪的機器。
這個機器剛開始還沒有出現任何問題，勉強可以看出一點點事情的經過，然而，帥不過三秒的希特隆還在解釋之時，機器強烈的晃動一下就發生了爆炸，結果是，所有人又擁有了一個新的髮型。爆炸發生后，柚莉嘉不忘吐槽一句：“哥哥又失敗了啦！”
此時此刻，莎莉娜着急的說道：“別在意這些問題了，我們首先得找個受傷不嚴重的訓練家問一下！”
莎莉娜他們找了許久，總算是找到了一個受傷輕微的訓練家，只見莎莉娜來到訓練家面前，問道：你好，這裡發生了什麼事？能告訴我一下嗎？”
那位訓練家喝了一口水說道：“我和我的寶可夢準備去商業街時，突然受到了一群聲稱是火箭隊的敵人，我還沒有和他們說話時，他們就襲擊了我，本來他們還繼續朝我們攻擊時，一隻寶可夢飛了過來，不知說了什麼，敵人就離開了這個地方。”
“那，你知道他們現在在哪裡嘛？”莎莉娜繼續問道。
“我偶爾聽他們說，他們準備去綠蘿鎮一處不遠處的森林，我想，他們應該還沒有走遠。訓練家接著說道。
“謝謝你！”謝過之後，莎莉娜一群人立刻趕往訓練家所說的森林。
……
另一邊，身帶重傷的小智和皮卡丘來到了一座清澈的小溪，小溪清澈黯然，可以看出，這個地方還沒有被火箭隊所攻佔。
看着清澈的小溪，小智不免有些口渴，有些艱難的來到小溪前，正準備喝水時，在他面前出現了一隻受傷的寶可夢，這隻寶可夢擁有着藍色的身體，藍色的緞帶，藍色的外表下，還有着閃光的外表。
“皮卡丘，那是？”
“Pika，pika！”（好熟悉啊，我們靠近看看！）
小智來到面前，仔細觀察之後，眼前的一幕讓他大吃一驚，沒錯，在他面前倒下的寶可夢，正是小智那和其他不一樣的——仙子精靈。
“仙子精靈，仙子精靈，快醒醒，快醒醒！”小智着急的搖了搖仙子精靈，然而，並沒有反應。
“可惡，沒辦法了，皮卡丘，快去小溪那弄點水來！”
“pika！”
因為小溪離他們沒有多遠，不一會兒，皮卡丘就用小手捧着水輕輕潑了過來。受到小溪的洗禮，仙子精靈慢慢睜開了她那粉色的眼睛，睜開粉色眼睛的同時，在她面前出現的，正是她最喜歡的那個訓練家——小智。
看着小智，仙子精靈別提有多高興，正準備撲向小智時，小智緩緩的躲開了，當然，仙子精靈感到疑惑。
“對不起，仙子精靈，我之前做了十分過分的事，你不想進寶可夢球，我卻一直想讓你進入，根本沒有考慮你的感受，不僅沒有考慮你的感受，還罵了你，我現在沒法親近你。”
沉默了一會兒，仙子精靈用她那彩色的緞帶，輕輕撫摸着小智。
“Feiya，Feiya…”（主人，這件事不用自責了，我已經原諒你了，其實我更想要的，只是想一隻待在你的身邊。）
“唔，這麼說，仙子精靈，你肯原諒我了？”
仙子精靈用她那彩色的緞帶纏繞着小智那受傷的左臂並點了點頭。
“太好了，仙子精靈！”小智激動的輕輕擁抱着仙子精靈；看着和好如初，皮卡丘也感到了無比的快樂。
……
在小智和仙子精靈相互處理着傷口時，莎莉娜他們終於來到了那位訓練家所說的森林。
來到森林，火箭隊的跟班們，早已經駐守在了森林邊緣，莎莉娜他們還沒進入森林，早已經被這些跟班們給發現了。
“來者何人？此地是禁止區域，我們老大正在裡面開會，要想活命的話，立刻滾出這個地方！”
“只見希特隆笑了笑，拿出寶可夢球后，說道：“上吧，倫琴貓，十萬伏特！”看門的跟班還沒反應過來就已經被擊敗逃跑了。
緊接着，或許是因為逃跑的人早已經上報給其他人，其他小嘍啰早已經做好了應戰的準備。
“看來守門的已經打報告了，接下來可能會迎來艱苦的戰鬥呢。”希特隆說道。
“哼哼，可別小看我們這些女孩子，跟了小智那麼久，除了能表演華麗大賽，對戰能力還是有的。”莎莉娜說道。
“那麼，我們就開始突擊吧。”此時此刻莎莉娜及夥伴們開始了逐個突破。
另一邊的小智，在和仙子精靈相遇后，簡單的解決了一一部分傷口后，再次開始尋找火箭隊之旅。
……
莎莉娜他們解決了大部分的嘍啰后，終於來到了本部，然而，他們並不知道，前方的超夢，正等着他們的到來。
來到本部，莎莉娜他們面前出現了一隻披着黑色披風的寶可夢，這隻寶可夢的身邊還站着熟悉的三人組，他們便是武藏、小次郎和喵喵。
“哼，都是一群廢物，最後還不是由我來出手，卑微的人類，接受吾等超夢的懲戒吧！”話剛說完，超夢直接使出了波導彈，只是莎莉娜等人反應很快，立刻躲開了攻擊，超夢自然打了一個空。
“躲開了？看來已經做好了準備嘛，不過，你們能堅持多久呢？”
“可惡，超夢嗎？他不是早已經放棄了解放寶可夢的計劃嗎？可為什麼他……”柚莉嘉倍感疑惑。
希特隆發現了什麼說道：“等等，這個之前我們和小智遇到的超夢不一樣，他並不是那一隻！”
“什麼！”所有人異口同聲道。
“你們還攻擊嗎？不攻擊的話，我們就上了！”武藏說道。
然而，正當武藏小次郎準備喚出自己的寶可夢時，超夢使用念力將他們給擊退不遠，這時武藏就不樂意了，怒道：“超夢，你在幹什麼！為什麼要攻擊我們？”
“攻擊你們？廢物就是廢物，你們給我滾遠一點！”超夢這麼說后，雖然火箭隊三人組非常不樂意，但沒有辦法，也只能聽超夢的，畢竟，超夢實在是太強了。
“哼，如果我們合力的話，一定會擊敗他的！”
或許是受到莎莉娜的情緒感染，放在小智包里的所有寶可夢，沒有召喚卻自己出來了；要說小智的寶可夢，那可大部分都是神獸級別，如蒂安希和美洛耶塔。
“大家！”
“放心吧，雖然我們沒法徹底將敵人打敗，但我們相信，一定能給予敵人重傷！”蒂安希說道。
“就拜託你們了，大家！”
……
經過苦戰，小智的寶可夢在沒有小智的指揮下，只不過輕微的傷了超夢。
“一群煩人的傢伙，就讓我來給予你們最後一擊吧！”此刻的超夢已經怒火衝天，使出了比以往還要強大的波導彈。
就在技能快擊中所有寶可夢時。
“……噴火龍，大字爆炎！”
“什麼！”
大字爆炎直接抵消了超夢的波導彈，白煙散去，在所有人面前出現的，是一位頭戴紅色帽子，身穿紅色衣服的訓練家，所有人看見這位訓練家后，大叫起來：“你是！”
