自初音未来与伙伴们在玄雍分离后，她跟随秦军来到了云梦泽并找到了分散多年的kaito。后来两人来到了稷下学院，同时meiko也跟着三分之地，自此当年从东京出发的五人组就此到齐。同时他们也听说了除蒙犽和孙膑外的稷下星之队和一些学生为了保护时空隧道壮烈牺牲的事实。之后他们来到星辰殿，在庄周，夫子，墨子这三位贤者的帮助下，他们的技能终于觉醒完了。三位贤者也告诉他们造成地球歌姬失踪的真实原因以及策划这些失踪事件的元凶普列罗斯想要干的事情。目前为止，普列罗斯已经开始动手了，地球上也出现了一些匪夷所思的灾难事件。于是初音未来等人在通过归墟梦演后踏上了击败普列罗斯的旅程。
出发的那一天，稷下学院的所有人都给他们送上了祝福，并为他们奏响出征的乐曲。
第18天，他们来到了神所在的城市倒悬天，没有人不对这来自方舟三号里面存储下来的科技造就的遗迹不感到惊奇。因为，在他们从地球出发时，人类文明传承及寻找净土的计划——方舟计划早已启动，那时方舟一号飞船尚未定型。所以对两千多年后的人类科技他们还是一无所知。
第36天，在渡过神之海后，初音未来一行人来到了王者峡谷的大草原，草原上，天与地合为一体，平整的草原很是宽阔，一望无际。遍地的羊群以及马群在草原上肆意奔跑着，远处不时传来几声狼的叫声。
第39天，他们终于来到了草原首领成吉思汗所在的地方——狼旗。在那他们看到了狼旗战士的威武以及首领的强大。就好像200多年前他们完成未来有你演唱会演出后在内蒙草原上所看到的那样。
第50天，他们来到了云中漠地，看到了基本上渺无人烟的金庭城。而当年坠落于此的巡音流歌告诉了初音未来等人的真相——在他们出发的前几天，普列罗斯派人将某种神秘药剂通过空间传送的方式撒在了水里从而导致魔种暴动，在云中漠地的所有城镇都遭遇了魔种的攻击。
沿着云中漠地里那条通往西方的大陆的用石砖铺就的大路一直向前，他们来到了那通往东西方最艰险也是最重要的地方——王者峡谷。在那里，他们与劫匪爆发了一场战斗，而meiko也在战斗中不慎被普列罗斯派来的人给绑架了。
那一天清晨也就是他们出征的第69天早晨，晚上刚下过雨的王者峡谷里的空气很是清新。而初音未来一行人在河道里不慎遭遇了打劫通过王者峡谷的行人的劫匪，于是初音未来等人严格意义上的团队实战就此展开。战场上除了他们，还有猎手组织，带头的米洛斯在几天前接受了普列罗斯的指令与那诱人的巨额赏金带人去抓捕歌姬。在初音未来等人与劫匪混战时，米洛斯看上了在战斗中落单的meiko，于是他化作kaito的模样带走了meiko。直到战斗结束，初音未来等人才发现meiko失踪的事实，于是他们互相指责着，不知不觉天就黑了。直到稷下传来消息，他们才知道，如果他们闹了分歧，则就真中了普列罗斯的诡计，到时候别提去救人了，所有的一切努力就白费了。于是，他们重新放下分歧，再一次上路了。
出征第109天，他们终于来到了离普列罗斯最近的城市也是很多年前由反叛的二十二个阿尔卡纳家族造就的城市海都，在那里他们见到了城市的执政者米莱狄并亲眼看到诅咒对那些人带来的影响。当年初音未来五人组队通过归墟梦演后，初音未来从通天塔得知了他们的歌声是解开神灵诅咒的解药。于是在进海城之前，初音未来利用巡音流歌给的录音设备录了一首她曾经唱过的《积乱云グラフィティ》并把录下来的东西存储在了八音盒里面。于是初音未来把那个八音盒交给了米莱狄的机械仆从。机械仆从将八音盒抬到米莱狄面前并打开了八音盒。于是初音未来的歌声就此流淌而出——
にわか雨が通り过ぎてく
ずぶぬれの仆らは立ち尽くして
夏の匂いが少しした
ねぇこのまま旅に出かけようよ
どこか远く
どれくらい时が过ぎたって
この思いを胸にしまって
仆らは生きてゆくんだ
爱とmusicそれだけでいいんだ
欲しいものは全てあるから
仆の中に。
在八音盒播放着初音未来录下的歌时，米莱狄的表情很是痛苦，于是她想让机械仆从把初音未来一行人扔到监牢之中。这一幕被对面被囚禁的芬奇大师看到了，于是便极力阻止米莱狄的行为并暗示米莱狄看自己的那结晶化严重的双手。米莱狄脱下了手套，只见结晶在慢慢减弱，歌声结束了，米莱狄的双手几乎恢复了。于是她代表被诅咒的那二十二个阿尔卡纳家族向初音未来求救。初音未来接受了米莱狄的求助，于是初音未来提出了举办演唱会的要求。米莱狄也答应了。之后几天，米莱狄身上的诅咒完全解除且自身所拥有的能力并未削弱，于是她给了初音未来更好的条件去举行她来到王者大陆严格意义上的第一场演唱会。终于，初音未来等人在机械仆从的帮助下布置好了一个小型室内演唱会的现场。那一天晚上，那二十二个阿尔卡纳家族的传承人以及其他遭遇诅咒的家族来到了现场。于是演唱会就这样举行了。整个演唱会的声音通过录音或者直播的形式在海都上荡漾着，同时危机悄然降临。演唱会结束后，每个被诅咒的家族带着录下的声音回到了各自的家里。海都外，普列罗斯听说初音未来到达海都后，便派人去攻击海城。于是海城战役爆发，上至执政者下至平民百姓以及初音未来等人他们在奋力保卫着这座由奇迹造就的城市。另一边，稷下学院呼吁各国军队前往跟随初音未来讨伐想要置王者大陆和地球于死地的普列罗斯，于是各国派出了自己家的精锐部队共计300多万人浩浩荡荡的前往海都。而稷下学院由于有机械巨鸟的缘故首先到达海都。大乔又通过漩涡之门将江东集结的部队都传送了过来并成功解救了meiko。随后的三个月时间里，云梦城的由刘邦，东皇太一率领的神灵者与汉军联队、由阿珂带领的南荒远征军、曹操带领的魏都部队、刘备率领的益城部队，由宫本武藏率领的扶桑远征军部队，由花木兰率领的长城守卫军，狄仁杰带领的大唐军队，嬴政带领的玄雍远征军、亚瑟带领日落圣殿骑士团，成吉思汗带领的狼旗卫队来到了海都。
当所有队伍集结完毕后，米莱狄也带着海都护卫队加入了这支浩大的队伍，自此一支由稷下学院领导的王者大陆护卫联合军在海都正式成立。于是，在稷下学院的带领下，联军开始了第一场战斗，之后的各国史书中都称此战役为——普列罗斯庄园战役。
由米莱狄带领的由海都护卫队组成的联军第七军和初音未来带领的由地球歌姬组成的联军第一军来到普列罗斯庄园门口便遭遇了普列罗斯的追随者组成的护卫队的袭击。于是各种各样的魔法，机关术遍地而起，护卫队失败，初音未来等人得以进入庄园以内。另一边诸葛亮通过初音未来传回的录像推算出了帝俊的具体位置在庄园靠左边的祭坛里。
在祭坛外，联军的先遣队死伤严重，而初音未来也陷入了深深的自责中，因为星尘和袅袅牺牲了。之后，初音未来立下了这样一条规矩——活着的歌姬或者虚拟主播要将倒下的歌姬与虚拟主播的数据芯片带回地球。但她自己却没想到很多天后牺牲的歌姬或虚拟主播里就有她自己。在与帝俊的战斗中，在所有人的努力下，帝俊终于倒下了，那么那颗方舟核心就在没有神明去争夺。但又有歌姬或虚拟主播倒下了。于是，初音未来等人将那些人的数据芯片一个个的放到了那带有格子的盒子里。之后初音未来带着人来到了魔法汲取室里，只见一些歌姬被关在了那一个个玻璃仪器里其中就包括镜音铃。在那里初音未来与安娜发生了战斗，魔法与魔法的碰撞，使得汲取室里火光十闪。几个回合下来，初音未来和安娜打得难解难分，于是安娜故意漏了个破绽。而初音未来也看到了，于是她发起了攻击，哪知入了圈套，只见安娜利用分身突袭到初音未来背面并念了一句不知道的咒语，于是初音未来陷入了昏迷
并倒在其中一个玻璃装置里。
“这就是所谓的世界第一公主殿下吗？论实力也不过如此嘛，那么就让我亲手结果你吧，这样普列罗斯大人知道后一定会好好的奖励我的。”安娜狂妄的说到。
“安娜，你是不是高兴太早了。想要结果初音未来，那么就先打过我。”只见初音未来缓缓的站了起来，于是安娜就再一次向初音未来发动攻击。哪知初音未来却发动了梅林的魔法。原来在初音未来倒下的瞬间，在海都的安琪拉由于羁绊的缘故觉察到了初音未来可能会出事，于是她念了一段灵魂置换的咒语将她自己与初音未来的灵魂做了置换。
“烈焰风暴！”只见初音未来将手合拢再把手掌打开，一道火焰直冲安娜而去，安娜很是震惊却忘了闪躲。之后初音未来再以混沌之火的法术攻击安娜，此刻安娜再也无法动弹。之后初音未来又通过混沌火球——火球术——炽热光辉组合结果了普列罗斯的手下干将之一安娜。于是初音未来再一次实施了灵魂交换的法术，她也倒下了。不过没多久她醒了，看到倒下的安娜她很是震惊。之后她带着人打碎了那一个个的玻璃仪器，只是其中一个却是空的，不知道发生了什么。而在玻璃仪器里的人除了最近遭到绑架的重音外，其他歌姬或是主播的生命体征都没有了。部队里，moumou酱先哭了出来，因为她看到了很早以前就遭到绑架的默默酱，而其他人也是，他们的伙伴也被发现了。于是他们忍痛拆下了失踪同伴身上的数据芯片。在此期间，有人看到了洛天依的宠物天钿并把它交给了初音未来。初音未来从那里看到了普列罗斯带走洛天依的那一段录像。
之后初音未来来到了书房，看到了普列罗斯的一系列勾当的记录。一切的一切终于有了原因，从那里初音未来得知了普列罗斯去往日之塔的情报，于是便把这些交给了稷下学院。
于是联军前往日之塔，在成吉思汗的带领下，他们来到了日之塔的底端大桥那里。只见机关守卫七零八落的倒在一边，另一端的大桥尽头的大门早已开启，于是王者大陆联军浩浩荡荡的走了进去，只见地面上满是魔种或是机关守卫早已冰凉的尸体，接着往前走，经过了几个安全屋后，由于电梯早已被普列罗斯损坏，于是宫本武藏带着军队和嬴政带领的军队一起来沿着电梯井来到了日之塔的最低处。很不巧的是那里的魔种再次被惊醒爆发出更加强大的攻击力，为了保护维修电梯的士兵，娜可露露和绊爱发动了羁绊技能“鹰之歌”但没招架住身受重伤，而乐正绫和东方镜在战斗中由于在玄雍战斗时留下的旧伤犯了，两人不慎被手持棍子的猴子击杀。另一边，嬴政和乐正龙牙的情况也不大好，他们被一只手持钉耙的猪给困住了并因此身受重伤。扶桑的勇士和秦军将领们一起击败了入侵的的魔种，但也受了伤。乐正龙牙在还没昏迷之前取下了乐正绫的数据芯片。电梯终于修好了，可是扶桑军队和玄雍军队却因为死伤严重不得不在一楼的各个安全屋休整。之后初音未来等人来到了反应炉那里，他们也不慎惊醒了那里的牛头等魔种。守卫在外围的魏都军队和狼旗军队就此遭殃在招架魔种的过程中meiko和大乔在发动羁绊技能“音轨传送”时技能被牛头魔种打断了，因此伤者无法传送。在护卫军队里相对安全的小乔和moumou酱看到大乔遭遇危机后想要去救大乔，当两人快到大乔身边时，三人不慎被牛头击飞，大乔和meiko因此牺牲，而moumou酱和小乔身受重伤。于是她们发动了羁绊技能“狂风之息”，于是她们周围的怪物基本上被消灭了。但是，牛头怪物的血量太厚了，于是她们再一次被击飞，两人就此牺牲。当孙策听说老婆牺牲后用自己的长帆破浪的技能击飞了牛魔，怎奈魔种太多，孙策被魔种包围，牛头魔种缓过气来将孙策抬起再重重摔在地上，孙策就这样牺牲了。另一边，狼旗军队遭受重创，首领成吉思汗和和亲的公主王昭君牺牲。导致大唐军队遭遇危机，队伍中的花木兰与恺和百里玄策因清理魔种而遭重伤。反应炉修好后，魏军与部分唐军在安全室休整。自此，前往日之塔顶端的联军只剩下六成。在前往日之塔顶端的路途中，初音未来等人终于看到了失踪已久的洛天依，于是她兴奋的跑了上去想要给天依一个拥抱。但洛天依却拿出了匕首向初音未来扎去，好在初音未来躲开了洛天依的第一轮攻击。
“天依，别闹，是我呀。”初音未来对着早已失控的洛天依惊慌的说到。可是洛天依似乎陷入了癫狂，她一直用匕首去想要伤害初音未来。
“Miku，天依似乎被控制了，不信你看她的眼睛！”另一边的巡音流歌大声的对初音未来叫到。于是当洛天依下一次攻击来到初音未来身前时，初音未来看到了洛天依的眼睛早已不是水灵灵的富有生机的翡翠绿色，而是空洞而充满死寂的血红色。
“迷人音符”初音未来对着洛天依使用了她的第二技能，于是洛天依被晕眩在那了。但当初音未来转过身想要回到巡音流歌身边时，意外发生了。只见洛天依的晕眩效果解除了，她再一次对初音未来发起攻击。这一次巡音流歌看在眼里并抽出了自己的剑。
“Miku小心！”巡音流歌拉开了初音未来，但巡音流歌却被洛天依刺中了，于是巡音流歌毫不犹豫的把匕首拿掉并击晕了洛天依，之后便晕了过去。于是初音未来取下了洛天依的数据芯片。
之后联军多次遭到魔种的袭击，虞姬，亚瑟等人牺牲，到达日之塔顶端的队伍不足两成。
只见普列罗斯缓缓的走上日之塔的最顶端，他似乎快要成功了。安琪拉和初音未来带着先锋部队冲了上去想要去阻止普列罗斯。普列罗斯不知用了什么魔法召唤出了一个防护罩将他和初音未来等人笼罩在内，随后普列罗斯念动咒语，只见天空中出现了吗许多的激光束，那些激光束照向防护罩内的所有人，除初音未来和安琪拉外的在防护罩里的所有人壮烈牺牲。后面赶到的军队由于防护罩的缘故无法支援初音未来和安琪拉。所以唯一能够阻止普列罗斯的只有安琪拉和初音未来了。
“呵呵，那个这不是不小心把自己困在气泡很多年的的魔法师吗？还有那位被我的魔法师击败的世界第一公主殿下吗？就你们还想阻止我的霸业？”普列罗斯狂妄的说到。“你们就在这好好见证我称霸地球和王者大陆的伟大时刻吧！”普列罗斯更加狂妄的说到。
“痴心妄想！有我们在你休想！”安琪拉愤怒的说到。
“为了这个你就涂灵王者大陆？为了这个你就不择手段的伤害我的伙伴？”初音未来大声质问着普列罗斯。
普列罗斯走到了日之塔的最中心位置，举起双手，似乎在念着什么神秘的咒语。只见日之塔外的土地裂开了许多大的裂缝，岩浆在缝隙中沸腾着。天空变得昏暗，电闪雷鸣。
“我们没时间了！”安琪拉说到。
“动手吧！”初音未来说到。
于是两人分别从两边对普列罗斯发起攻击。但失败了。两人都被击飞掉落在远处。于是初音未来和安琪拉发起第二次进攻，都被普列罗斯给击飞了。她们多次这样做，得到的依旧是一样的结果。
“就你们这水平还想击败我？现在投降还来得及，待我称霸王者大陆和地球后，给你们更多的荣华富贵。”普列罗斯在吸收星球之血时对着倒地的两人说到。
“现在该怎么办，现在再小的声音他也能听见。”初音未来说到
“闭上眼睛，睡一觉。”安琪拉说到
“都这个时候了呀，你还静得下来吗？”初音未来说到。
“放心，听我的就是了。”安琪拉说到。
于是两人闭上眼睛，在意识里讨论着对策。防护罩外的将士们看到两人这样情绪万千，惊慌的，义愤填膺的，失望的……终于初音未来和安琪拉的讨论终于出了结果，只见安琪拉单独冲向普列罗斯，普列罗斯再一次击飞了安琪拉。但是安琪拉乘着击飞时给的力量向初音未来释放了混沌火球。
“初音未来，接下来就拜托了。”安琪拉对着初音未来默默说到。
只见初音未来踏上了混沌火球并再一次起跳并使出二技能阶梯音符，只见音符和火焰一起构成阶梯，初音未来一级一级往上跳跃着。而安琪拉落地后召唤出了大熊之后和大熊一起冲向普列罗斯，大熊被击飞了。而安琪拉也准备释放三技能炽热光辉，但普列罗斯也注意到了安琪拉，于是召唤出魔法阵对安琪拉展开致命攻击，最终安琪拉败下阵来，奄奄一息，她微笑着看着初音未来。当初音未来已经到达普列罗斯头上时，两人共同使出了他们的羁绊技能。
“羁绊技·火焰音符”初音未来的掌心出现了一道火焰，于是她向普列罗斯加速而去，而普列罗斯看到安琪拉还能呼吸于是又一次召唤魔法阵去攻击安琪拉，就这样，安琪拉壮烈牺牲……
另一边，初音未来方面情况也不大好。她的数据开始崩坏。
“调教数据遭到篡改，尝试阻止失败。”
“视听系统崩坏，尝试系统第一次自我修复。”
“视听系统修复失败，尝试第二次修复。”
初音未来发现数据崩坏时并没有停止，反而加快了自己进攻的步伐。另一边普列罗斯正在进行吸收星球之血的最后一步，这一步一旦完成，普列罗斯就能够称霸王者大陆与地球。不过他已大难临头。只见初音未来像一枚导弹那样精准命中了普列罗斯并使用了三技能初始之音。可是初音未来的系统崩坏程度却越来越高。
“存储系统损坏，请尝试修复”
“主系统崩坏，正在尝试启用备用系统”
“备用系统启动失败，请检查系统文件是否存在。”
此刻，普列罗斯因为初音未来的巨大冲击波终于被击败倒下。而初音未来的所有数据已严重崩坏。就这样，初音未来也倒下了……
另一端，尝试联系初音未来的人听到了这样一句重复的话语然后再无音讯——
“深刻なエラーが発生しました”
王者大陆的灾难停止了，地球也稳定了。于是众人欢呼着，随后陷入了悲伤。受了轻伤的kaito来到日之塔顶端取下了初音未来的数据芯片，随后来到反应炉那里取下了meiko和moumou的数据芯片。现在的日之塔陷入了深深的悲伤中。只听到公孙离唱响了那首初音未来生前教她唱过的《odds&ends》——
你一直是被嘲笑的一方 无论做什麼都不太顺利 最後还有大雨倾盆 喜欢的伞却也被风吹走 路人说著你辛苦了 踩上一脚 你和往常一样被厌恶著 即使什麼都不做却仍被疏远著 虽然试过努力 但他人理由却是「就是这麼觉得?」 无计可施的你那样悲伤过 那麼就来用我的声音吧 ……
随后，所有人附和着，奏响了悲歌。随后歌姬们回到了稷下学院，经过长时间的恢复后，稷下学院再一次开启了时空隧道。此刻已是大唐历大唐五十四年，幸存下来的歌姬将牺牲的或是倒下的歌姬的芯片分批次带回了地球。
当巡音流歌等人回到地球后已是2359年农历春节。V家的所有歌姬喜极而泣。时间转眼来到了5月9日，所有人的数据修复已经开始。直至2380年9月7日，然而这几十年的记忆，他们都没有。
